В своё время форумчанин bayakin предложил такой способ. Вот только не найду что-то здесь этого сообщения, но текст его был таким:
Небольшой FAQ по редактированию BD3D ISO без сценариста с помощью TSMuxer, BluFab и BDEdit. Проверено на BD3D Стражи галактики.
Загружаем в TSMuxer основной плейлист с фильмом (номер плейлиста можно определить с помощью BDInfo).
Редактируем содержимое. Я заменил одну дорогу и одну удалил, чтобы всё поместилось на BD50.
Сохраняем как Blu-Ray ISO. В нем находятся 5 нужных нам файлов. 1 файл SIFF и 2 файла M2TS в папке STREAM и 2 файла CLPI в папке CLIPINF.
Исходный диск распаковываем в папку. Заменяем в нем исходные 5 файлов полученными. Переименовываем их на первоначальные имена (как в исходном диске).
Если формат дороги изменился, то открываем нашу папку в BDEdit, ищем основной плейлист, в нем изменяем формат дорожек или удаляем их, если удаляли дорожки в TSMuxer. Если заменили одну AC3 дорогу на другую или DTS на DTS, правка в BDEdit не нужна.
Открываем BluFab, ищем вкладку копирование. Перетаскиваем туда нашу папку, выбираем на выходе формат ISO.
Получаем отредактированный BD3D ISO. Воспроизведение проверено на PowerDVD 15 и железном Pioneer BDP-140.
На Arcsoft TotalMedia Theatre 6 не пошло(
Способ рабочий.